Νέα μέθοδος προσδιορισμού των καλλιεργειών ελιάς

Μια νέα ημιαυτόματη μεθοδολογία για τον εντοπισμό των ελαιοκαλλιεργειών σύμφωνα με την εμφάνιση των φύλλων και των φρούτων προορίζεται να χρησιμεύσει ως βάση για μια τηλεφωνική εφαρμογή για παραγωγούς και συνεισφορές σε μια νέα διεθνή βάση δεδομένων ελιάς, σύμφωνα με τον Κωνσταντίνο Μπλαζάκη, ερευνητή Ο Παναγιώτης Καλαϊτζής στο Τμήμα Γενετικής και Βιοτεχνολογίας Κηπουρικής στο Μεσογειακό Αγρονομικό Ινστιτούτο Χανίων (MAICh) στην Κρήτη.

Ο Blazakis ελπίζει ότι μια εφαρμογή αυτής της νέας μεθόδου θα είναι μια εφαρμογή κινητού τηλεφώνου που θα είναι σε θέση να αναγνωρίσει την ποικιλία με βάση μια φωτογραφία ενός φρούτου, φύλλου ή ενδοκάρπου ελιάς. Αναμένει να ξεκινήσει με ελληνικές ποικιλίες εντός του επόμενου έτους ή δύο και ελπίζει να κερδίσει υποστήριξη για να προσθέσει διεθνείς ποικιλίες σε αυτήν την εφαρμογή ως συμπληρωματικό έργο αργότερα. Παραδέχεται ότι η εφαρμογή κινητού τηλεφώνου θα είναι πιθανώς πιο χρήσιμη σε χώρες όπου υπάρχουν πολλές διαφορετικές ποικιλίες ελιάς, καθώς οι αγρότες θέλουν να είναι σίγουροι ότι γνωρίζουν ποια ποικιλία έχουν.

Ένας άλλος από τους στόχους του Blazakis είναι να συνεισφέρει σε μια νέα διεθνή διαδικτυακή βάση δεδομένων που θα καταγράφει πληροφορίες σχετικά με την εμφάνιση και τη χημική ανάλυση, μεταξύ άλλων, των ποικιλιών ελιάς παγκοσμίως. Είπε ότι δεκαπέντε εταίροι από διάφορες χώρες συνεργάζονται για να προετοιμάσουν αυτήν τη φιλική προς το χρήστη βάση δεδομένων για το ευρύ κοινό, η οποία θα είναι ​"με βάση τη γενετική, φυσιολογική, μοριακή και μορφολογική μελέτη κάθε καλλιέργειας. "Οι ερευνητές σκοπεύουν να ενσωματώσουν προηγούμενα δεδομένα, να ελέγξουν διπλά για ακρίβεια, καθώς και να προσθέσουν νέες πληροφορίες.

Πρόκειται για ένα ευρύτατο, φιλόδοξο πρόγραμμα Bioresources For Oliviculture ή BeFOre, το οποίο έχει χρηματοδοτηθεί από την Ευρωπαϊκή Ένωση 2020 Horizon έρευνας και καινοτομίας στο πλαίσιο της συμφωνίας επιχορήγησης Marie Skłodowska-Curie και υποστηρίζεται επίσης από το Διεθνές Συμβούλιο Ελαιολάδου.

Το BeFOre είναι ​"επικεντρώθηκε στην καθιέρωση ολοκληρωμένων κοινών πρωτοκόλλων για τον φαινότυπο και το χαρακτηρισμό των φυτών σε μοριακό, μορφολογικό και φυσιολογικό επίπεδο και στην αξιολόγηση της ποιότητας του ελαιόλαδου που σχετίζεται με τις ποικιλίες ", δικτυακός τόπος, ​"προσδοκώντας να βελτιώσουν τις δυνατότητες των συλλογών, των αποθεμάτων και των τραπεζών του Ελβετικού Germplasm ως κύριες πηγές μεταβλητότητας και των εργαλείων αξιολόγησης που θα χρησιμοποιηθούν για την αύξηση της βιωσιμότητας της ελαιοκαλλιέργειας και για την αντιμετώπιση των υφισταμένων και προκλητικών προβλημάτων ".

Υπογραμμίζοντας τη σημασία της αξιολόγησης και χαρακτηρισμού της ποικιλομορφίας των ειδών της ελιάς για τη διατήρηση της πλούσιας ποικιλίας των γενετικών πόρων με όλα τα διαφορετικά οφέλη για την υγεία τους, ο Μπλαζάκης επικεντρώνεται στη μορφή και τη δομή ή τη μορφολογία των ελιών, των ελαιόδεντρων και των φύλλων τους.

Στο 3^rd Διεθνές Συμπόσιο για την Κηπουρική στην Ευρώπη στα Χανιά, Κρήτη στα μέσα Οκτωβρίου, ο Μπλάζακης παρουσίασε το έργο που επιτελεί σε συνεργασία με τη Λουκιανά Μπαλντόνι και τη Μαρίνα Μπούτστσι από το Ιταλικό Εθνικό Συμβούλιο Έρευνας Abdelmajid Moukhli από το INRA Marrakech στο Μαρόκο και τον Παναγιώτη Καλαϊτζή από το MAICh (που είναι μέρος του Διεθνούς Κέντρου Προηγμένων Μεσογειακών Αγρονομικών Μελετών).

Σε μια παρουσίαση με τίτλο ​"Προηγμένοι μαθηματικοί αλγόριθμοι για τον χαρακτηρισμό των ποικιλιών ελιάς μέσω μορφολογικών παραμέτρων, ο Μπλάζακης εξήγησε ότι ​"Η μελέτη στοχεύει στην παρουσίαση μιας εντελώς νέας ημιαυτόματης μεθοδολογίας για την ανίχνευση διαφόρων μορφολογικών παραμέτρων »διαφορετικών ελαιώνων. Η μέθοδος του περιλαμβάνει 5 βήματα:

• συλλέξτε δείγματα φύλλων και φρούτων: 25 ή 30 από τη μέση ενός δέντρου του οποίου η ποικιλία έχει προσδιοριστεί σε φυτώριο
• δημιουργήστε δεδομένα απεικόνισης: τραβήξτε φωτογραφίες από αυτά
• κατάτμηση: διαχωρίστε την εικόνα των φύλλων, των ελιών ή των σπόρων από το φόντο χρησιμοποιώντας επιστημονικό λογισμικό
• Εφαρμογή μαθηματικών αλγορίθμων: χρησιμοποιήστε λογισμικό MATLAB για να δημιουργήσετε ένα σύνολο οδηγιών που σχετίζονται με διάφορες πτυχές της μορφής και της δομής της ελιάς ή του φύλλου, για παράδειγμα (για τον καρπό) περιοχή, περίμετρος, ύψος, μέγιστο πλάτος, θέση μέγιστου πλάτους, συμμετρία ή έλλειψη συμμετρίας, σχήματος έλλειψης, καμπυλότητας, θηλής
• μεταφράζουν αποτελέσματα: καταλήγουν σε αριθμούς που περιγράφουν κάθε πτυχή της μορφής και της δομής κάθε ελαιοκαλλιέργειας

Ο Μπλαζάκης ανέφερε ότι είναι απαραίτητο να διεξαχθούν περισσότερες δοκιμές για να βεβαιωθούμε ότι οι μορφολογικές παράμετροι με τις οποίες εργάζεται η ομάδα του μπορούν να διακρίνουν μεταξύ διαφορετικών ποικιλιών, αλλά πιστεύει ότι θα πετύχουν. Πρόσθεσε ότι το αυτοματοποιημένο εργαλείο που αναπτύσσει θα παρέχει μια ταχύτερη και λιγότερο δαπανηρή μέθοδο για τον προσδιορισμό μιας ελαιοκαλλιέργειας από την ανάλυση DNA και θα προσφέρει μια χρήσιμη επιλογή για πολλούς αγρότες που αναζητούν πληροφορίες για τα δέντρα τους.

• Βιολογικές πηγές για την ελαιοκαλλιέργεια, ή η περιγραφή του προγράμματος BeFOre


• III Διεθνές Συμπόσιο για την Κηπουρική στην Ευρώπη - SHE2016